2031 год. Прогресс в области кибернетики позволяет людям заменять утраченные конечности высокотехнологичными протезами. Капитан Мотоко Кусанаги из 9-го отдела службы безопасности расследует серию загадочных кибератак, источником которых является таинственный хакер, известный под псевдонимом Кукловод.
В ходе расследования выясняется, что преступник обладает уникальными способностями взламывать нейроинтерфейсы. Мотоко приходится использовать все свои навыки и связи в киберпространстве, чтобы противостоять этой угрозе, пока загадочный Кукловод продолжает свою опасную игру.